?　水素イオン（プロトン）生成

植物の光合成では、非循環的光リン酸化とよばれる2段階の反応によってATPとNADPHの両方が生産される。2つの化学反応のうち第一段の光化学系?（PS?）では、2つの水分子の酸素が水分解酵素中のマンガン原子群に結合し、下記の反応で02およびH＋を放出する。

また、光化学系?（PS?）の活性中心の中核部分はプラストキノンという強力な電子供与体をつくりだす。キノンの電子は電気化学的勾配が形成され、ATP生産に用いられる。

近年、PS?だけでも水素（分子）製造が可能であることが米国オークリッジ研究所のグループにより示された。これは、クラミドモナスのB4（PS?が欠損している）でH2の製造が確認されたものである。

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